Stosując narzędzie Microsoft Baseline Security Analyzer możemy szybko poddać diagnozie nasze zabezpieczenia. Aplikacja bowiem umożliwia wyłapanie wszelkich luk w systemie i służy radą jak poprawić poziom bezpieczeństwa naszego komputera.
Program Microsoft Baseline Security Analyzer dokonuje skanowania w systemach Windows NT, 2000 lub XP, a następnie wyszukuje błędy w konfiguracji zabezpieczeń , po czym po zakończeniu skanowania wyświetla raport. Ponadto narzędzie dokonuje sprawdzenia konfigurację aplikacji Internet Explorer, Microsoft Office, Internet Information Services (IIS) oraz SQL Server. Dodatkowo sprawdza, czy zainstalowaliśmy łatki bezpieczeństwa dla Internet Explorera, Windows Media Playera czy Microsoft Data Access Components (MDAC).
W celu uruchomienia programu MBSA , który również został wyposażony w interfejs graficzny należy wybrać Start/Programy, a następnie kliknąć Microsoft Baseline Security Analyzer 1.2.1. Wersję tekstową uruchamianą z wiersza poleceń wywołamy, wpisując komendę MBSACLI w katalogu, gdzie został zainstalowany.